著PetShop版本的更新，其分層式結構也在不斷的完善，例如PetShop2.0，就沒有采用標准的三層式結構，如圖三：
圖三：PetShop 2.0的體系架構
從圖中我們可以看到，並沒有明顯的數據訪問層設計。這樣的設計雖然提高了數據訪問的性能，但也同時導致了業務邏輯層與數據訪問的職責混亂。一旦要求支持的數據庫發生變化，或者需要修改數據訪問的邏輯，由於沒有清晰的分層，會導致項目作大的修改。而隨著硬件系統性能的提高，以及充分利用緩存、異步處理等機制，分層式結構所帶來的性能影響幾乎可以忽略不計。
PetShop3.0糾正了此前層次不明的問題，將數據訪問邏輯作為單獨的一層獨立出來：
圖四：PetShop 3.0的體系架構
PetShop4.0基本上延續了3.0的結構，但在性能上作了一定的改進，引入了緩存和異步處理機制，同時又充分利用了ASP.Net 2.0的新功能MemberShip，因此PetShop4.0的系統架構圖如下所示：
圖五：PetShop 4.0的體系架構
比較3.0和4.0的系統架構圖，其核心的內容並沒有發生變化。在數據訪問層（DAL）中，仍然采用DAL Interface抽象出數據訪問邏輯，並以DAL Factory作為數據訪問層對象的工廠模塊。對於DAL Interface而言，分別有支持MS-SQL的SQL Server DAL和支持Oracle的Oracle DAL具體實現。而Model模塊則包含了數據實體對象。
其詳細的模塊結構圖如下所示：
