java.net刊登了一篇由Sharad Acharya所寫的名為Java PersistenceFramework:Which, When, andWhat?"href="http://today.Java.Net/pub/a/today/2007/12/18/adopting-java-persistence-framework.Html">JavaPersistenceFramework: Which, When, andWhat?的文章，文中比較了四種流行的持久化框架：CMPEntityEJBs、JPA、Hibernate和TopLink。Acharya討論了每種技術並在一個表格中總結了他的結論，其結論歸結為：
JPA
適合J2SE和J2EE的簡單框架，並入了其他框架的許多有用特性，但是需要Java 5或更高版。
CMP Entity EJBs
J2EE容器所支持的框架，擁有安全和事務管理、很好的可伸縮性、以及分布式的組件能力，但是耗費資源且學習和使用較為復雜。
Hibernate
簡單、靈活的框架，完全免費且易於與其他框架集成，但由於是開源的，因而可能有支持問題。
TopLink
Oracle的中心框架，十分成熟，但是使用它意味著綁死在一個單一廠商上。
該文章引發了相當數量的評論，尤其是圍繞著JPA和EJB3.0中的EntityBeans之間的關系、以及作為開源框架的Hibernate的潛在不利因素方面的評論。
一個評論者在其關於Entity Beans和JPA的評論中這樣寫道：
該文章討論了使用JDBC的Bean-Managed Persistence(BMP)與Container-ManagedPersistence之間的對比，但是EJB3.0為實體bean持久化引入了一個全新的模型。我必須假設作者在這裡討論的是EJB2.x。“遠程接口模型”的討論也暗示了作者仍然在談論EJB2.x，而且他文章中的大部分針對 EnterpriseJavaBean的背景信息及所羅列的缺點實際上是對EJB 1.x和 EJB2.x而言的，而非針對EJB3.0。這有點混亂，因為作者提及了EJB3.0使用注解消除了許多伴隨在以前版本EJB左右的編碼困難。但是在下一個句子裡他接著說道，“EJB架構的學習和使用絕非易事”，並且羅列了一些以前EJB版本的一些常見問題。作者還談到了EJB在其他框架中不能使用，但是 EJB3.0使用了“普通”Java類，它可以在其它框架中使用，只要這些框架忽略掉該普通Java類的JPA注解即可。JPA作為EJB3規范的一部分被創建，而且是EJB3的固有部分。該規范制定者確定符合JPA規范的實現應當支持SE環境。該作者提到了JPA在EJB和SE環境下都可以工作，但是接著又說要使用JPA，JavaEE5是必須的。這不是事實，因為要使JPA工作，SE並不需要依賴於EE。該篇文章所羅列的JPA的一個“不利因素”是 JPA的能力受限於實現廠商。事實是“廠商”必須實現所有規范要求，包括Hibernate(它也是一個JPA實現的“廠商”)。有些人可能不得不自己寫類庫或框架，唯一的問題是他們所寫的類庫或框架是否與標准兼容。而其他一些人所涵蓋的框架“可能”是基於標准的(構建在標准之上)，Java對象關系映射持久化框架自身就是標准，它是一套Java持久化API。EJB3.0和JPA之間是單向依賴。任何EJB3.0實現應當被預期為是大量基於JPA的，但是JPA出現並不意味著EJB必須出現，因為JavaSE可以使用JPA。
另一個抱怨把開源作為一個不利因素的描述如下：
我認為我不同意你關於“開源是不利因素”的直白敘述。實際上，這種論調具有一定的誤導，它實際上可能會給你的項目增加不利因素。我所工作的一個項目決定用Kodo替代Hibernate，僅僅因為LGPL還不夠友好(不利因素，等等)。當我看了代碼之後我發現這是多麼錯誤的一個決定……Hibernate那時遠遠勝出而且現在我仍然這麼看。現在維護起來困難且棘手。工作量完全不一樣……
盡管如此，有些人還是插話表達對作者主張的支持：你會將賭注押在誰身上呢?
開源項目通常“是”一個不利因素，而且Hibernate確實有嚴重的支持問題。除非你向該組織付費，否則你將發現他們的支持非常糟糕。Bug報告和特性要求將伴以粗陋的評論而被關閉掉。張貼在論壇上的討論會被忽略。普通(免費)支持將來也會很困難。任何正在考慮使用Hibernate的人應該認識到，90%的時間它會像魔法一樣在工作，但是你將會浪費“數以天計”的時間修改那剩下的10%。他們通過使產品更難使用和掌控支持來獲利，這是他們掙錢的方式，就像其他開源項目一樣。Hibernate最大的易用性問題是其異常消息。有時你會得到一個誤導性的錯誤信息，把你引向一個錯誤的方向。還有時你會得到非常模糊的信息，讓你無法判斷什麼地方出了錯。如果你提出一個RFE，要求他們改善錯誤報告，你將會得到一個粗陋的評論，而且這個RFE將迅速被關閉。這只是我的個人看法。
