以上的學習過程如果是比較順利的話，進行到這一步，難度又陡然提高。因為上面的知識內容都是只涉及一個方面，而像EJB，JMS，JTA等核心的J2EE（J2EE培訓 ）規范往往是幾種Java技術的綜合運用的結晶，所以掌握起來難度比較大。
首先一定要學習好JNDI，JNDI是App Server定位服務器資源（EJB組件，Datasouce，JMS）查找方法，如果對JNDI不熟悉的話，EJB，JMS這些東西幾乎學不下去。JNDI其實就是Javax.naming.*這個包，運用起來很簡單。難點在於服務器資源文件的配置。對於服務器資源文件的配置，就需要看看專門的文檔規范了，比如web.xml的寫法，ejb-jar.XML的寫法等等。針對每種不同的App Server，還有自己的服務資源配置文件，也是需要熟悉的。
然後可以學習JTA，主要是要理解JTA對於事務的控制的方法，以及該在什麼場合使用JTA。這裡可以簡單的舉個例子，我們知道一般情況可以對於一個數據庫連接進行事務控制(conn.setAutoCommit(false),....,conn.commit())，做為一個原子操作，但是假設我的業務需求是要把對兩個不同數據庫的操作做為一個原子操作，你能做的到嗎？這時候只能用JTA了。假設操作過程是先往A數據庫插一條記錄，然後刪除B數據庫另一個記錄，我們自己寫代碼是控制不了把整個操作做為一個原子操作的。用JTA的話，由App Server來完成控制。
在學習EJB之前要學習對象序列化和RMI，RMI是EJB的基礎。接著學習JMS和EJB，對於EJB來說，最關鍵是要理解EJB是如何通過RMI來實現對遠端對象的調用的，以及在什麼情況下要用到EJB。
在學習完EJB，JMS這些東西之後，你可能會意識到要急不可待學習兩個領域的知識，一個是UML，另一個是Design Pattern。Java企業軟件的設計非常重視框架(Framework)的設計，一個好的軟件框架是軟件開發成功的必要條件。在這個時候，應該開始把學習的重點放在設計模式和框架的學習上，通過學習和實際的編程經驗來掌握EJB的設計模式和J2EE的核心模式。
J2EE規范裡面，除了EJB，JMS，JTA，Servlet/JSP，JDBC之外還有很多很多的企業技術，這裡不一一進行介紹了。
另外還有一個最新領域Web Services。Web Services也完全沒有任何新東西，它像是一種黏合劑，可以把不同的服務統一起來提供一個統一的調用接口，作為使用者來說，我只要獲得服務提供者給我的WSDL（對服務的描述），就夠了，我完全不知道服務器提供者提供的服務究竟是EJB組件，還是.Net組件，還是什麼CORBA組件，還是其他的什麼實現，我也不需要知道。Web Services最偉大的地方就在於通過統一的服務提供方式和調用方式，實現了整個Internet服務的共享，是一個非常令人激動的技術領域。Web Services好像目前還沒有什麼很好的書籍，但是可以通過在網絡上面查資料的方式來學習。
