本文根據Denis Piliptchouk的文章翻譯、摘錄而來，有些術語翻譯不太好理解，還請參考原文。
第一部分 安全配置和代碼封裝
安全配置
兩個平台的配置都是通過XML或純文本文件，兩個平台最大的區別在於處理安全配置體系的方式不同。
在.NET平台，有圖形接口和命令行二種方式來修改安全配置參數。Mscorcfg.msc是圖形接口方式，CASPol.exe提供了命令行方式，適用於批處理或配置文本。
Java平台只提供了圖形接口的工具policytool.exe。和.NET不同的是，它的目標對象（配置文件）的名字和位置不是固定的。
.NET定義了不同范圍的安全配置文件：系統范圍，本機范圍，本用戶范圍。在配置有沖突時，原則上小范圍的參數有優先權。
JAVA和J2EE的核心配置文件都保存在固定位置，但擴展配置文件隨廠家不同而不同。
代碼封裝：檢驗
JAVA 和.NET 的Common Library Runtime (CLR) 都實行內存安全或類型安全的保護機制，在這些平台開發的應用的安全性也是可以檢驗的。他們的實現機制有很大的不同。
在.NET， CLR總是執行編譯好的代碼，它不解釋代碼。但是在中間語言（IL）被編譯之前，編譯器會有驗證和檢驗的步驟。第一步是檢查文件的結構和代碼完整性；第二步包括一些擴展的檢查，內存安全、堆棧跟蹤、數據流分析、類型檢查等。在運行階段，由VES (Virtual Execution System) 來負責安全性檢查和出錯意外情況處理。
在JAVA平台，JAVA虛擬機（JVM）負責類的載入、鏈接、檢驗和執行。對於已經編譯和優化的代碼，JVM也用二個無條件調用堆棧來保留最初的字節代碼信息。
小結：和.NET不同，JVM的默認設置是不檢驗本地代碼。另外，JVM保留最初的字節代碼供運行時檢查，而.NET把靜態分析和運行時插入檢驗代碼相結合。
代碼封裝：應用隔離
在.NET， 域隔離建立在內存安全機制的基礎上，不同的域不能直接訪問彼此的地址空間，只能通過.NET遠程通信機制訪問。
在JAVA平台，應用隔離是通過ClassLoaders 和 ProtectionDomains 相結合來實現的，安全類加載是JVM安全機制的基石。
小結：.NET的 AppDomains 就象操作系統的進程一樣，使用起來比JAVA的 ProtectionDomains 更直接、輕易一些。
代碼封裝： 語言特征
兩個平台基本上差不多，.NET在靈活性上稍微好一點。
總結：
JAVA在安全配置上有較多的優勢，.NET在代碼封裝的選擇性和易用性好一些。
第二部分 加密和通信
加密法：概論
.NET的加密法主要基於CryptoAPI 和相關擴展。大多數有關加密的類都在System.security.Cryptography, X509Centificates 和XML中。.NET利用基於流的模型來完成加密傳輸，所有的算法都被默認為最高的安全級別。.NET也答應用戶自己在 machine.config 中定義自己的算法。
JAVA平台的加密算法分二個部分：Java Cryptography Architecture (JCA) 和 Java Cryptography Extension (JCE)。 JCE的出口受到有關法律的限制。假如要使用用戶自己的加密算法，必須得到認證機構（SUN 或 IBM）的認證。
加密法：算法
.NET主要提供了下面幾大類加密算法：非對稱算法、HASH算法、對稱算法、隨機數生成法。
JAVA提供的加密算法更多，但是較少第三方廠商可以在JAVA中提供自己的算法。
