PHP本身再老版本有一些問題，比如在 php4.3.10和php5.0.3以前有一些比較嚴重的bug，所以推薦使用新版。另外，目前鬧的轟轟烈烈的SQL Injection也是在PHP上有很多利用方式，所以要保證安全，PHP代碼編寫是一方面，PHP的配置更是非常關鍵。
我們php手手工安裝的，php的默認配置文件在 /usr/local/apache2/conf/php.ini，我們最主要就是要配置php.ini中的內容，讓我們執行php能夠更安全。整個PHP中的安全設置主要是為了防止phpshell和SQL Injection的攻擊，一下我們慢慢探討。我們先使用任何編輯工具打開/etc/local/apache2/conf/php.ini，如果你是采用其他方式安裝，配置文件可能不在該目錄。
(1) 打開php的安全模式
php的安全模式是個非常重要的內嵌的安全機制，能夠控制一些php中的函數，比如system()，
同時把很多文件操作函數進行了權限控制，也不允許對某些關鍵文件的文件，比如/etc/passwd，
但是默認的php.ini是沒有打開安全模式的，我們把它打開：
safe_mode = on
(2) 用戶組安全
當safe_mode打開時，safe_mode_gid被關閉，那麼php腳本能夠對文件進行訪問，而且相同
組的用戶也能夠對文件進行訪問。
建議設置為：
safe_mode_gid = off
如果不進行設置，可能我們無法對我們服務器網站目錄下的文件進行操作了，比如我們需要
對文件進行操作的時候。
(3) 安全模式下執行程序主目錄
如果安全模式打開了，但是卻是要執行某些程序的時候，可以指定要執行程序的主目錄：
safe_mode_exec_dir = D:/usr/bin
一般情況下是不需要執行什麼程序的，所以推薦不要執行系統程序目錄，可以指向一個目錄，
然後把需要執行的程序拷貝過去，比如：
safe_mode_exec_dir = D:/tmp/cmd
但是，我更推薦不要執行任何程序，那麼就可以指向我們網頁目錄：
safe_mode_exec_dir = D:/usr/www
(4) 安全模式下包含文件
如果要在安全模式下包含某些公共文件，那麼就修改一下選項：
safe_mode_include_dir = D:/usr/www/include/
其實一般php腳本中包含文件都是在程序自己已經寫好了，這個可以根據具體需要設置。
(5) 控制php腳本能訪問的目錄
使用open_basedir選項能夠控制PHP腳本只能訪問指定的目錄，這樣能夠避免PHP腳本訪問
不應該訪問的文件，一定程度上限制了phpshell的危害，我們一般可以設置為只能訪問網站目錄：
open_basedir = D:/usr/www
(6) 關閉危險函數
如果打開了安全模式，那麼函數禁止是可以不需要的，但是我們為了安全還是考慮進去。比如，
我們覺得不希望執行包括system()等在那的能夠執行命令的php函數，或者能夠查看php信息的
phpinfo()等函數，那麼我們就可以禁止它們：
disable_functions = system,passthru,exec,shell_exec,popen,phpinfo
如果你要禁止任何文件和目錄的操作，那麼可以關閉很多文件操作
disable_functions = chdir,chroot,dir,getcwd,opendir,readdir,scandir,fopen,unlink,delete,copy,mkdir, rmdir,rename,file,file_get_contents,fputs,fwrite,chgrp,chmod,chown
以上只是列了部分不叫常用的文件處理函數，你也可以把上面執行命令函數和這個函數結合，
就能夠抵制大部分的phpshell了。
(7) 關閉PHP版本信息在http頭中的洩漏
我們為了防止黑客獲取服務器中php版本的信息，可以關閉該信息斜路在http頭中：
expose_php = Off
比如黑客在 telnet www.chinaz.com 80 的時候，那麼將無法看到PHP的信息。
(8) 關閉注冊全局變量
在PHP中提交的變量，包括使用POST或者GET提交的變量，都將自動注冊為全局變量，能夠直接訪問，
這是對服務器非常不安全的，所以我們不能讓它注冊為全局變量，就把注冊全局變量選項關閉：
register_globals = Off
當然，如果這樣設置了，那麼獲取對應變量的時候就要采用合理方式，比如獲取GET提交的變量var，
那麼就要用$_GET[’var’]來進行獲取，這個php程序員要注意。
(9) 打開magic_quotes_gpc來防止SQL注入
SQL注入是非常危險的問題，小則網站後台被入侵，重則整個服務器淪陷，
所以一定要小心。php.ini中有一個設置：
magic_quotes_gpc = Off
這個默認是關閉的，如果它打開後將自動把用戶提交對sql的查詢進行轉換，
比如把 ’ 轉為 ’等，這對防止sql注射有重大作用。所以我們推薦設置為：
magic_quotes_gpc = On
(10) 錯誤信息控制
一般php在沒有連接到數據庫或者其他情況下會有提示錯誤，一般錯誤信息中會包含php腳本當
前的路徑信息或者查詢的SQL語句等信息，這類信息提供給黑客後，是不安全的，所以一般服務器建議禁止錯誤提示：
display_errors = Off
如果你卻是是要顯示錯誤信息，一定要設置顯示錯誤的級別，比如只顯示警告以上的信息：
error_reporting = E_WARNING & E_ERROR
當然，我還是建議關閉錯誤提示。
(11) 錯誤日志
建議在關閉display_errors後能夠把錯誤信息記錄下來，便於查找服務器運行的原因：
log_errors = On
同時也要設置錯誤日志存放的目錄，建議根apache的日志存在一起：
error_log = D:/usr/local/apache2/logs/php_error.log
注意：給文件必須允許apache用戶的和組具有寫的權限。
MYSQL的降權運行
新建立一個用戶比如mysqlstart
net user mysqlstart ****microsoft /add
net localgroup users mysqlstart /del
不屬於任何組
如果MYSQL裝在d:mysql ，那麼，給 mysqlstart 完全控制 的權限
然後在系統服務中設置，MYSQL的服務屬性，在登錄屬性當中，選擇此用戶 mysqlstart 然後輸入密碼，確定。
重新啟動 MYSQL服務，然後MYSQL就運行在低權限下了。
如果是在windos平台下搭建的apache我們還需要注意一點，apache默認運行是system權限，
這很恐怖，這讓人感覺很不爽.那我們就給apache降降權限吧。
net user apache ****microsoft /add
net localgroup users apache /del
ok.我們建立了一個不屬於任何組的用戶apche。
我們打開計算機管理器，選服務，點apache服務的屬性，我們選擇log on，選擇this account，我們填入上面所建立的賬戶和密碼，
重啟apache服務，ok，apache運行在低權限下了。
實際上我們還可以通過設置各個文件夾的權限，來讓apache用戶只能執行我們想讓它能干的事情，給每一個目錄建立一個單獨能讀寫的用戶。
這也是當前很多虛擬主機提供商的流行配置方法哦，不過這種方法用於防止這裡就顯的有點大材小用了。
