摘要：本文記錄了在CentOS 6.3上，把MySQL從5.5.28升級到5.6.19的過程。
在我做的一個項目中，最近我對生產服務器上的一系列系統軟件進行了升級，包括Git、Nginx、MySQL和PHP。這篇文章講的是升級MySQL的過程，其他軟件的升級，可見下面列出的文章。
在我加入這個項目之前，服務器上的MySQL已經安裝設置好了，我只是正常使用而已。現在過去1年了，應該適當升級服務器上的軟件了。升級這種事情是應當經常做的，倒不是為了追最新版本，而是當正式版本發放出來的時候，應該及時更新， 以便獲得最新的更正、補丁，避免服務器上的漏洞，減少安全隱患。
升級是在今年6月11-12日進行的，到今天才有空做個記錄，便於日後參考。
動手之前，查找了很多資料，因為MySQL要比之前升級的Git和Nginx要復雜多了。我在參考資料中列出了我所能找到作為依據的文檔，可供參考。
我們使用的服務器是阿裡雲的，服務器的操作系統是CentOS 6.3。登錄管理界面，發現共有兩塊物理硬盤，一塊系統盤，一塊數據盤，而我們只使用了系統盤，數據盤一直空著沒用。所以，計劃就變成：
下面的操作需要以超級管理員root的身份登錄服務器進行操作。
首先，查看硬盤使用情況：
# fdisk -l
Disk /dev/xvda: 21.5 GB, 21474836480 bytes
255 heads, 63 sectors/track, 2610 cylinders
Units = cylinders of 16065 * 512 = 8225280 bytes
Sector size (logical/physical): 512 bytes / 512 bytes
I/O size (minimum/optimal): 512 bytes / 512 bytes
Disk identifier: 0x00000000
Device Boot Start End Blocks Id System
/dev/xvda1 * 1 2550 20480000 83 Linux
/dev/xvda2 2550 2611 490496 82 Linux swap / Solaris
Disk /dev/xvdb: 21.5 GB, 21474836480 bytes
255 heads, 63 sectors/track, 2610 cylinders
Units = cylinders of 16065 * 512 = 8225280 bytes
Sector size (logical/physical): 512 bytes / 512 bytes
I/O size (minimum/optimal): 512 bytes / 512 bytes
Disk identifier: 0x00000000
# df -h
Filesystem Size Used Avail Use% Mounted on
/dev/xvda1 20G 9.4G 11G 48% /
tmpfs 498M 0 498M 0% /dev/shm
可以看到，邏輯盤/dev/xvda1是位於根目錄(/)，/dev/xvda2是系統緩存(swap)。第二塊物理硬盤/dev/xvdb的大小是21.5 GB，沒有加載和使用，我們可以把它加載，並把MySQL的數據遷移到第二塊物理硬盤上，把對系統盤和數據庫的硬盤訪問分流，希望這樣一定程度上可以提高訪問MySQL數據庫的性能。
格式化第二塊物理硬盤：
# mke2fs -j /dev/xvdb
mke2fs 1.41.12 (17-May-2010)
Filesystem label=
OS type: Linux
Block size=4096 (log=2)
Fragment size=4096 (log=2)
Stride=0 blocks, Stripe width=0 blocks
1310720 inodes, 5242880 blocks
262144 blocks (5.00%) reserved for the super user
First data block=0
Maximum filesystem blocks=4294967296
160 block groups
32768 blocks per group, 32768 fragments per group
8192 inodes per group
Superblock backups stored on blocks:
32768, 98304, 163840, 229376, 294912, 819200, 884736, 1605632, 2654208,
4096000
Writing inode tables: done
Creating journal (32768 blocks): done
Writing superblocks and filesystem accounting information: done
This filesystem will be automatically checked every 24 mounts or
180 days, whichever comes first. Use tune2fs -c or -i to override.
格式化順利完成。
下面，加載第二塊物理硬盤為/data目錄：
# mount /dev/xvdb /data
這個命令沒有反饋，當時我有點兒吃驚和失落。因為這許多命令我也都是第一次從網上查到，第一次使用，對於它們的輸出和結果，都有一種第一次坐過山車般的期待、興奮、好奇和不確定，每一次的輸出對於我都是新的，你不知道翻過面前這個坡之後會出現什麼！
再用下面的命令查看新的邏輯盤：
# df -kh Filesystem Size Used Avail Use% Mounted on /dev/xvda1 20G 9.3G 11G 48% / tmpfs 498M 0 498M 0% /dev/shm /dev/xvdb 20G 173M 19G 1% /data
可以看到/dev/xvdb是第二塊物理硬盤！激動，成功了！
用下面的命令查看加載(mount)的類型：
# mount /dev/xvda1 on / type xfs (rw) proc on /proc type proc (rw) sysfs on /sys type sysfs (rw) devpts on /dev/pts type devpts (rw,gid=5,mode=620) tmpfs on /dev/shm type tmpfs (rw) none on /proc/sys/fs/binfmt_misc type binfmt_misc (rw) /dev/xvdb on /data type ext3 (rw)
到這裡，第二塊物理硬盤加載成功，下面該yum出場了。
不好意思，yum同學，編劇說你還要等下一幕。
升級MySQL時，又做了兩個計劃：
下面大部分命令都需要在超級管理員root的權限下運行。
用mysqldump來備份所有的數據庫數據：
# mysqldump -u <db管理員用戶名> -p --all-databases > 2014-06-12_all-db.sql
會提示輸入密碼，然後2014-06-11_all-db.sql就是備份數據，如果不想放在當前目錄下，可以在上面的命令行上指定路徑。
當然，也建議你單獨備份每個用戶數據庫：
# mysqldump -u <db管理員用戶名> -p mydb > 2014-06-12_mydb.sql
妥善保存這些非常重要的數據庫備份文件。
用下面的命令查看MySQL的版本：
# mysql --version mysql Version 14.14 Distrib 5.5.28, for Linux (x86_64) using reeadline 5.1
可見，當前的MySQL的版本是5.5.28。
這是參照參考資料[7]來做的，後來發現[6]的方法更好：
# wget http://dev.mysql.com/get/mysql-community-release-el6-5.noarch.rpm # rpm -ivh mysql-community-release-el6-5.noarch.rpm # yum list | grep mysql
這樣很多更新的MySQL安裝包就都有了。
如有必要，運行下面的命令確保yum安裝庫是最新的：
# yum update mysql-community-release
用下面的命令查看安裝了什麼：
# yum list installed | grep ^mysql mysql-community-release.noarch
其中，^mysql是指以mysql開頭的安裝包。
用下面的命令查看安裝了的和可用的安裝包：
# yum info mysql-server Installed Packages Name : MySQL-Server Arch : x86_64 Version : 5.5.28 Release : 1.linux2.6 Repo : installed Available Packages Name : mysql-server Arch : x86_64 Version : 5.1.73 Release : 3.el6_5 Repo : updates
這裡不知道為啥可用的安裝包沒有顯示MySQL 5.6的。
檢查可用的安裝包：
# yum check-update mysql-server
Obsoleting Packages
mysql-community-client.x86_64 5.6.19-2.el6 mysql56-community
MySQL-client.x86_64 5.5.28-1.linux2.6 installed
mysql-community-devel.x86_64 5.6.19-2.el6 mysql56-community
MySQL-devel.x86_64 5.5.28-1.linux2.6 installed
mysql-community-server.x86_64 5.6.19-2.el6 mysql56-community
MySQL-server.x86_64 5.5.28-1.linux2.6 installed
可見，MySQL 5.6的安裝包都算community版本了。
運行下面的命令：
# yum update mysql-server
Dependencies Resolved
================================================================================
Package Arch Version Repository Size
================================================================================
Installing:
mysql-community-client x86_64 5.6.19-2.el6 mysql56-community 18 M
replacing MySQL-client.x86_64 5.5.28-1.linux2.6
mysql-community-server x86_64 5.6.19-2.el6 mysql56-community 52 M
replacing MySQL-server.x86_64 5.5.28-1.linux2.6
Installing for dependencies:
mysql-community-common x86_64 5.6.19-2.el6 mysql56-community 298 k
mysql-community-libs x86_64 5.6.19-2.el6 mysql56-community 1.9 M
Transaction Summary
================================================================================
Install 4 Package(s)
後面的輸出省略了。可見有4個安裝包(共70多MB)要下載、安裝。結果，下載用了80分鐘。
但安裝遇到問題了：
Running rpm_check_debug Running Transaction Test Transaction Check Error: file /usr/bin/mysql_config from install of mysql-community-client-5.6.19-2.el6 .x86_64 conflicts with file from package MySQL-devel-5.5.28-1.linux2.6.x86)64 Error Summary -------------
可以看到出錯了，搜索了一陣兒，也沒搞明白。隨即停止A計劃(和成龍的電影沒關系)，改用B計劃。
可以預料，這個計劃要多折騰一些。仍然需要在超級管理員root的權限下運行下面的命令。
這時為了避免用戶訪問網站時，看到數據庫連接失敗這樣的錯誤信息。到這時我才想起這一點來，還是對用戶關懷不夠，應該在有可能宕掉網站的操作之前就做的。
因為使用的是Nginx，所以運行下面的命令：
# service nginx stop
Stopping nginx: [ OK ]
一共有3個包要卸載。
先卸載mysql-server包:
# yum remove mysql mysql-server Dependencies Resolved ================================================================================ Package Arch Version Repository Size ================================================================================ Removing: MySQL-server x86_64 5.5.28-1.linux2.6 installed 153 M Transaction Summary ================================================================================ Remove 1 Package(s) Installed size: 153 M Is this ok [y/N]: y Downloading Packages: Running rpm_check_debug Running Transaction Test Transaction Test Succeeded Running Transaction Warning: RPMDB altered outside of yum. Erasing : MySQL-server-5.5.28-1.linux2.6.x86_64 1/1 Verifying : MySQL-server-5.5.28-1.linux2.6.x86_64 1/1 Removed: MySQL-server.x86_64 0:5.5.28-1.linux2.6 Complete!
再卸載mysql-client:
最後卸載mysql-devel：
3個包的卸載都順利完成。
安裝比卸載更簡單，因為yum會自動檢查依賴安裝包：
# yum install mysql-server Dependencies Resolved ================================================================================ Package Arch Version Repository Size ================================================================================ Installing: mysql-community-server x86_64 5.6.19-2.el6 mysql56-community 52 M Installing for dependencies: mysql-community-client x86_64 5.6.19-2.el6 mysql56-community 18 M mysql-community-common x86_64 5.6.19-2.el6 mysql56-community 298 k mysql-community-libs x86_64 5.6.19-2.el6 mysql56-community 1.9 M Transaction Summary ================================================================================ Install 4 Package(s) Total size: 72 M Installed size: 323 M Is this ok [y/N]: y Downloading Packages: Running rpm_check_debug Running Transaction Test Transaction Test Succeeded Running Transaction Installing : mysql-community-common-5.6.19-2.el6.x86_64 1/4 Installing : mysql-community-libs-5.6.19-2.el6.x86_64 2/4 Installing : mysql-community-client-5.6.19-2.el6.x86_64 3/4 Installing : mysql-community-server-5.6.19-2.el6.x86_64 4/4 warning: /etc/my.cnf created as /etc/my.cnf.rpmnew /bin/chmod: cannot access `': No such file or directory Verifying : mysql-community-common-5.6.19-2.el6.x86_64 1/4 Verifying : mysql-community-libs-5.6.19-2.el6.x86_64 2/4 Verifying : mysql-community-client-5.6.19-2.el6.x86_64 3/4 Verifying : mysql-community-server-5.6.19-2.el6.x86_64 4/4 Installed: mysql-community-server.x86_64 0:5.6.19-2.el6 Dependency Installed: mysql-community-client.x86_64 0:5.6.19-2.el6 mysql-community-common.x86_64 0:5.6.19-2.el6 mysql-community-libs.x86_64 0:5.6.19-2.el6 Complete!
由於篇幅關系，輸出有所縮略。一切順利，繼續！
預告：繁瑣的事情這才開始。
更改\etc\my.cnf，下面只列出更改的相關設置：
[mysqld] # Uncomment the following if you are using InnoDB tables #innodb_data_home_dir = /var/lib/mysql # data path changed to 2nd physical hard disk /dev/xvdb after upgrading from MySQL 5.5 to MySQL 5.6 innodb_data_home_dir = /data/mysql #innodb_data_file_path = ibdata1:10M:autoextend #innodb_log_group_home_dir = /var/lib/mysql datadir = /data/mysql
如果你也更改了數據目錄，最後一行的 datadir = /data/mysql 切不可遺漏，我就是因為這一行實際上沒有及時改，還是指向舊的數據目錄，導致數據升級失敗，直到升級數據之後才發現，在下文中有詳細論述。
啟動服務：
# service mysql start mysql: unrecognized service
居然出錯了！只好直接運行MySQL的daemon：
# /etc/init.d/mysqld start Starting mysqld: [ OK ]
後來才知道，mysql是MySQL 5.5的服務名稱，到了MySQL 5.6服務就改名為mysqld了。所以，其實這裡可以運行service mysqld start的。
按照參考資料[6]，到這時，MySQL的程序已經升級完畢，要升級數據了。
先把舊數據目錄下的所有文件都拷貝到新的數據目錄下。可惜，這裡的命令在我的工作日志中沒有記錄，日後找到再不上。不過這是基本的Linux命令，就算你不知道，也一定能在網上找到。
然後運行下面的命令：
# mysql_upgrade -uroot -p Enter password: Looking for 'mysql' as: mysql Looking for 'mysqlcheck' as: mysqlcheck Running 'mysqlcheck' with connection arguments: '--port=<為安全故略去>' '--socket=/var/lib/mysql/mysql.sock' Warning: Using a password on the command line interface can be insecure. Running 'mysqlcheck' with connection arguments: '--port=<為安全故略去>' '--socket=/var/lib/mysql/mysql.sock' Warning: Using a password on the command line interface can be insecure. mysql.columns_priv OK mysql.db OK mysql.event OK mysql.func OK # ... ... 為省略篇幅故略去 ... ... mysql.time_zone_transition OK mysql.time_zone_transition_type OK mysql.user OK Running 'mysql_fix_privilege_tables'... Warning: Using a password on the command line interface can be insecure. Running 'mysqlcheck' with connection arguments: '--port=<為安全故略去>' '--socket=/var/lib/mysql/mysql.sock' Warning: Using a password on the command line interface can be insecure. Running 'mysqlcheck' with connection arguments: '--port=<為安全故略去>' '--socket=/var/lib/mysql/mysql.sock' Warning: Using a password on the command line interface can be insecure. mydb.table1 OK mydb.table2 OK # ... ... 為省略篇幅故略去 ... ... mydb.table793 OK mydb.table794 OK OK
到這裡發現，數據庫有問題，數據升級並未成功。原因就是之前提及的，升級數據時\etc\my.cnf中的數據目錄(即datadir = 這一行)還是指向舊的數據目錄，我猜想這導致一些操作發生了混亂。
這時我感覺到難免的慌張和混亂，之後我做了一些嘗試：
不得不就此作罷。
看起來由於我之前的疏忽，數據庫已經在上一步升級數據中被損毀了！
這時候，你能做什麼！谷歌(或者百度)就是你當前最好的朋友！
在冒汗和揪頭發的折磨中，總算找到了根救命稻草mysql_install_db，詳見參考資料[9]，這個命令可以重新創建數據目錄，這就意味著重新創建系統數據庫mysql，也意味著現有的用戶數據庫都將被清除。這時，你會感謝上帝、佛祖、聖母和玉皇大帝，如果你在最開始對所有的數據庫做了備份的話。回頭看一下我們在5.1 備份所有的數據庫做的事情，就知道這是多麼重要了！有了備份，我們就可以恢復所有的數據庫了！
先要做的，是在MySQL的配置文件中設置正確的數據目錄。再次更改\etc\my.cnf，下面只列出更改的相關設置：
[mysqld] datadir = /data/mysql
然後，祭出我們的救命稻草mysql_install_db來重新創建數據目錄(如果你想知道該命令的詳細參數，可見參考資料[9])：
# /usr/bin/mysql_install_db --user=mysql --datadir=/data/mysql Installing MySQL system tables...2014-06-13 00:35:17 0 [Warning] TIMESTAMP with implicit DEFAULT value is deprecated. Please use --explicit_defaults_for_timestamp server option (see documentation for more details). 2014-06-13 00:35:17 11574 [Note] InnoDB: Using atomics to ref count buffer pool pages 2014-06-13 00:35:17 11574 [Note] InnoDB: The InnoDB memory heap is disabled 2014-06-13 00:35:17 11574 [Note] InnoDB: Mutexes and rw_locks use GCC atomic builtins 2014-06-13 00:35:17 11574 [Note] InnoDB: Compressed tables use zlib 1.2.3 2014-06-13 00:35:17 11574 [Note] InnoDB: Using Linux native AIO 2014-06-13 00:35:17 11574 [Note] InnoDB: Using CPU crc32 instructions 2014-06-13 00:35:17 11574 [Note] InnoDB: Initializing buffer pool, size = 128.0M 2014-06-13 00:35:17 11574 [Note] InnoDB: Completed initialization of buffer pool 2014-06-13 00:35:17 11574 [Note] InnoDB: Highest supported file format is Barracuda. 2014-06-13 00:35:17 11574 [Note] InnoDB: 128 rollback segment(s) are active. 2014-06-13 00:35:17 11574 [Note] InnoDB: Waiting for purge to start 2014-06-13 00:35:17 11574 [Note] InnoDB: 5.6.19 started; log sequence number 44199093 2014-06-13 00:35:17 11574 [Warning] InnoDB: Cannot open table mysql/innodb_table_stats from the internal data dictionary of InnoDB though the .frm file for the table exists. See http://dev.mysql.com/doc/refman/5.6/en/innodb-troubleshooting.html for how you can resolve the problem. ERROR: 1146 Table 'mysql.innodb_table_stats' doesn't exist 2014-06-13 00:35:17 11574 [ERROR] Aborting 2014-06-13 00:35:17 11574 [Note] Binlog end 2014-06-13 00:35:18 11574 [Note] InnoDB: FTS optimize thread exiting. 2014-06-13 00:35:18 11574 [Note] InnoDB: Starting shutdown... 2014-06-13 00:35:19 11574 [Note] InnoDB: Shutdown completed; log sequence number 44199103 2014-06-13 00:35:19 11574 [Note] /usr/sbin/mysqld: Shutdown complete
又出錯了！別慌，這是因為數據目錄並未清空，其中還有之前損毀的數據庫文件。
刪除當前的數據目錄。我實際做的是把 /data/mysql 改名為 /data/mysql.bak2，效果一樣，/data/mysql 目錄不存在了，只是我做了個物理文件備份。
再次重建數據目錄：
# /usr/bin/mysql_install_db --user=mysql --datadir=/data/mysql Installing MySQL system tables...2014-06-13 00:46:06 0 [Warning] TIMESTAMP with implicit DEFAULT value is deprecated. Please use --explicit_defaults_for_timestamp server option (see documentation for more details). 2014-06-13 00:46:06 11654 [Note] InnoDB: Using atomics to ref count buffer pool pages 2014-06-13 00:46:06 11654 [Note] InnoDB: The InnoDB memory heap is disabled 2014-06-13 00:46:06 11654 [Note] InnoDB: Mutexes and rw_locks use GCC atomic builtins 2014-06-13 00:46:06 11654 [Note] InnoDB: Compressed tables use zlib 1.2.3 2014-06-13 00:46:06 11654 [Note] InnoDB: Using Linux native AIO 2014-06-13 00:46:06 11654 [Note] InnoDB: Using CPU crc32 instructions 2014-06-13 00:46:06 11654 [Note] InnoDB: Initializing buffer pool, size = 128.0M 2014-06-13 00:46:06 11654 [Note] InnoDB: Completed initialization of buffer pool 2014-06-13 00:46:06 11654 [Note] InnoDB: The first specified data file /data/mysql/ibdata1 did not exist: a new database to be created! 2014-06-13 00:46:06 11654 [Note] InnoDB: Setting file /data/mysql/ibdata1 size to 12 MB 2014-06-13 00:46:06 11654 [Note] InnoDB: Database physically writes the file full: wait... 2014-06-13 00:46:06 11654 [Note] InnoDB: Setting log file ./ib_logfile101 size to 48 MB 2014-06-13 00:46:07 11654 [Note] InnoDB: Setting log file ./ib_logfile1 size to 48 MB 2014-06-13 00:46:09 11654 [Note] InnoDB: Renaming log file ./ib_logfile101 to ./ib_logfile0 2014-06-13 00:46:09 11654 [Warning] InnoDB: New log files created, LSN=45781 2014-06-13 00:46:09 11654 [Note] InnoDB: Doublewrite buffer not found: creating new 2014-06-13 00:46:09 11654 [Note] InnoDB: Doublewrite buffer created 2014-06-13 00:46:09 11654 [Note] InnoDB: 128 rollback segment(s) are active. 2014-06-13 00:46:09 11654 [Warning] InnoDB: Creating foreign key constraint system tables. 2014-06-13 00:46:09 11654 [Note] InnoDB: Foreign key constraint system tables created 2014-06-13 00:46:09 11654 [Note] InnoDB: Creating tablespace and datafile system tables. 2014-06-13 00:46:09 11654 [Note] InnoDB: Tablespace and datafile system tables created. 2014-06-13 00:46:09 11654 [Note] InnoDB: Waiting for purge to start 2014-06-13 00:46:09 11654 [Note] InnoDB: 5.6.19 started; log sequence number 0 2014-06-13 00:46:10 11654 [Note] Binlog end 2014-06-13 00:46:10 11654 [Note] InnoDB: FTS optimize thread exiting. 2014-06-13 00:46:10 11654 [Note] InnoDB: Starting shutdown... 2014-06-13 00:46:12 11654 [Note] InnoDB: Shutdown completed; log sequence number 1625977 OK Filling help tables...2014-06-13 00:46:12 0 [Warning] TIMESTAMP with implicit DEFAULT value is deprecated. Please use --explicit_defaults_for_timestamp server option (see documentation for more details). 2014-06-13 00:46:12 11678 [Note] InnoDB: Using atomics to ref count buffer pool pages 2014-06-13 00:46:12 11678 [Note] InnoDB: The InnoDB memory heap is disabled 2014-06-13 00:46:12 11678 [Note] InnoDB: Mutexes and rw_locks use GCC atomic builtins 2014-06-13 00:46:12 11678 [Note] InnoDB: Compressed tables use zlib 1.2.3 2014-06-13 00:46:12 11678 [Note] InnoDB: Using Linux native AIO 2014-06-13 00:46:12 11678 [Note] InnoDB: Using CPU crc32 instructions 2014-06-13 00:46:12 11678 [Note] InnoDB: Initializing buffer pool, size = 128.0M 2014-06-13 00:46:12 11678 [Note] InnoDB: Completed initialization of buffer pool 2014-06-13 00:46:12 11678 [Note] InnoDB: Highest supported file format is Barracuda. 2014-06-13 00:46:12 11678 [Note] InnoDB: 128 rollback segment(s) are active. 2014-06-13 00:46:12 11678 [Note] InnoDB: Waiting for purge to start 2014-06-13 00:46:12 11678 [Note] InnoDB: 5.6.19 started; log sequence number 1625977 2014-06-13 00:46:12 11678 [Note] Binlog end 2014-06-13 00:46:12 11678 [Note] InnoDB: FTS optimize thread exiting. 2014-06-13 00:46:12 11678 [Note] InnoDB: Starting shutdown... 2014-06-13 00:46:14 11678 [Note] InnoDB: Shutdown completed; log sequence number 1625987 OK
後面還有一些輸出，只是一些說明，關於如何准備MySQL的服務、如何設置管理員密碼、等等。
好了，到這裡，看起來總算恢復都正常了。
繼續，設置管理員密碼：
# mysqladmin -u root password '********'
這時，只是重建了系統數據庫mysql，原先的用戶數據庫都沒了。要先創建(空的)用戶數據庫，然後從備份恢復。
進入MySQL命令行：
# mysql -u root -p Enter password: Welcome to the MySQL monitor. Commands end with ; or \g. Your MySQL connection id is 7 Server version: 5.6.19 MySQL Community Server (GPL)
再創建用戶數據庫：
mysql> CREATE DATABASE `mydb`; Query OK, 1 row affected (0.00 sec) mysql> exit Bye
這時，mydb數據庫還是空的。從之前的數據庫備份恢復mydb：
# mysql -u root -p mydb < 2014-06-12_mydb.sql Enter password:
用戶數據庫順利恢復。
開啟mysqld服務的開機啟動狀態：
# chkconfig mysqld on
再查看：
# chkconfig --list mysqld mysqld 0:off 1:off 2:on 3:on 4:on 5:on 6:off
正確！繼續。
對應於6.1 停止web服務器，我們要再次開啟網站、允許用戶訪問了：
# service nginx start Starting nginx: [ OK ]
測試網站，一切正常！
其實網站還有點兒小問題，不過這和MySQL升級無關，只是作為完整的實際過程，記錄在這裡。
實際上這時還是無法訪問網站的，訪問網站主頁時遇到下面的錯誤：
2014-06-13 01:07:23 Warning: Warning (2): mysql_connect() [<a href='http://php.net/function.mysql-connect'>function.mysql-connect</a>]: No such file or directory in [/usr/share/nginx/.../cake/libs/model/datasources/dbo/dbo_mysql.php, line 561]
根據參考資料[11]，修改CakePHP 1.3代碼中的app/config/database.php:
class DATABASE_CONFIG {
public $default = array(
'datasource' => 'Database/Mysql',
'persistent' => false,
'host' => 'localhost',
'login' => 'username',
'password' => 'password',
'database' => 'mydb',
'prefix' => ''
,'encoding' => 'utf8'
,'port' => '/data/mysql/mysql.sock'
);
如上所示，增加了port的設置。注意，這只適用於*nix系統，Windows上是不需要這樣的。另，CakePHP 2.x的設置與此略有不同，請參考相關文檔。
這樣網站就能正常訪問了。
源碼編譯咯，當然注意數據備份，官方有這方面的文檔的
附：修改數據文件存儲
1、停止服務；
2、移動MySQL數據文件
[root@localhost ~]# mv /var/lib/mysql /home/
3、修改my.cnf配置
[root@localhost ~]# vi /etc/my.cnf
[mysqld]
port = 3306
#socket = /var/lib/mysql/mysql.sock（原內容，為了更穩妥用“#”注釋此行）
socket = /home/mysql/mysql.sock
4、修改啟動腳本
[root@localhost ~]# vi /etc/init.d/mysql
#datadir=/var/lib/mysql（注釋原內容）
datadir=/home/data/mysql
5、重啟服務如啟動失敗，檢查目錄/文件權限。
