瑞金醫院HIS系統的主要應用是門急診，它包括掛號子系統、診間子系統、護士台子系統、收費子系統和藥方子系統。醫院采用的Sybase 數據庫產品為 Adaptive Server Enterprise 11.9.2 for HP-UX，開發工具為 PowerBuilder Enterprise 7.0。數據庫服務器由兩台 HP K250小型機組成。其中一台承擔著瑞金醫院的門診業務系統。另一台承擔著瑞金醫院的報表和查詢分析業務系統。目前系統的終端有100多個，終端上運行的相關應用的設計和開發由Sybase公司優秀的4GL快速開發工具PowerBuilder實現，目前系統運行非常好。
基於Sybase數據庫系統的新的HIS系統具有非常優秀的性能。在采用新的HIS以前，瑞金醫院采用由上海華東電腦公司開發的老HIS系統，醫院每天的病人數量一般在5000到6000人次，系統所連接的終端有五六十台，處理每筆交易需要1-2分鐘，門診藥房和收費處戲稱計算機系統"心肌梗塞"，晚上收費日報更是需要5-10分鐘，新的系統上線後，在服務器硬件基本沒有大的變動的情況下，終端數量由原來的50-60台增加到100多台，而每筆交易的處理時間由原來的1-2分鐘下降到1-2秒，系統性能提高了60倍。
新的HIS系統具有靈活的外部接口，它順利實現了醫院內部醫療卡與上海醫保發行的白玉蘭卡並行使用，同時也順利實現了與上海醫療保險系統的成功對接。 在新系統上線後，隨著醫院服務質量的提高，每天到瑞金醫院的就醫人數已經上升了近一倍，醫院的收入有了很大提高。該系統的成功運行得到了社會各個方面的充分肯定。1999年11月28日,上海市三位副市長及上海市衛生局、上海醫保局、上海電子辦等部門到上海瑞金醫院實地考察,到門診現場實地查看並聽取了瑞金醫院院長匯報。上海市常務副市長當即稱贊"李院長有水平",並要求衛生局選一到二家HIS系統在全市推廣。1999年11月30日，上海市衛生局長帶領有關業務人員及技術人員又對瑞金醫院進行實地考察，並對該項目作了深入了解，對該系統給予肯定。
